Los dos grandes altares de mármol están alineados de este a oeste en la zona central del Ágora. Uno, llamado Altar A, se alza casi en el centro de la Platea Inferior, mirando hacia el Pórtico Norte; el otro, llamado Altar B, flanquea al primero por el este. La construcción de ambos altares, que no son contemporáneos, tuvo lugar en época helenística, probablemente en dos momentos con pocos años de diferencia. El altar más antiguo, datable entre finales del siglo IV y la primera mitad del III a.C., cuando la plaza pública ya estaba completamente regularizada, se erige con el lado principal orientado hacia el sur y no hacia el este, como era habitual en época griega. Los dos altares son iguales en su estructura exterior, pero difieren en las dimensiones generales, el corte y el grosor de los bloques, el acabado y la unidad de medida utilizada. Un eje de bloques de mármol recorre el borde de los cimientos de piedra caliza, formando la euticinterna del monumento y sirviendo de escalón inferior en el lado norte. El alzado consta de una alta crepidina de cuatro escalones delimitados por parapetos, el último de los cuales, más ancho que los demás, sirve de prótesis, y la caja del altar, formada por una cornisa de coronación. Sobre esta última, a lo largo del frente meridional, descansa una espaldera decorada en la parte superior con un marco ovalado y, a lo largo de los lados llamados "orejas", moldeada a lo largo del borde de la gaccia exterior y decorada en la base con hojas de acanto. El Altar B, construido a imitación del Altar A, pero con mayor precaución en el uso del mármol e incluso de la grapa, presenta las mismas curvaturas en los peldaños que las utilizadas por razones ópticas en los zócalos de los templos. Los dos altares se derrumbaron en el terremoto de finales del siglo III. Los bloques de mármol del paramento exterior y los de piedra caliza del núcleo interior se reutilizaron en la mampostería tardía de algunos edificios. Algunos elementos se han encontrado incluso en el Santuario de Apolo, en el Barrio Central y en la Acrópolis.