L'autel d'Artémis présente une structure en calcaire similaire à celle de l'autel d'Apollon et des joues en forme d'oreille. Constitué d'une simple salle quadrangulaire divisée par deux colonnes au centre, le temple était peut-être à l'origine dédié aux deux divinités, Apollon et Artémis, les deux fils de Zeus et de Latone.